Diversidad genética del cacao Nacional ecuatoriano del banco de germoplasma de Tenguel-Guayas, Ecuador, con base en SNP’S

Autores/as

  • Quevedo State Technical Univ. (UTEQ). Ecuador.
  • International Center for Tropical Agriculture (CIAT). Cali-Palmira, Colombia.
  • International Center for Tropical Agriculture (CIAT). Cali-Palmira, Colombia.
  • Quevedo State Technical Univ. (UTEQ). Ecuador.
  • Quevedo State Technical Univ. (UTEQ). Ecuador.
  • Quevedo State Technical Univ. (UTEQ). Ecuador.
  • Quevedo State Technical Univ. (UTEQ). Ecuador.
  • National University of Colombia (UNAL), Faculty of Agricultural Sciences, Molecular Biology Laboratory. Palmira, Valle del Cauca, Colombia.

Palabras clave:

Diversidad genética, germoplasma, marcadores moleculares, SNPs

Resumen

Se estudió la diversidad genética y estructura de 80 introducciones de Theobroma cacao L. ‘Nacional’ existente en la finca “La Buseta”, Tenguel-Guayas, Ecuador. La caracterización  incluyó 19 controles y  96 marcadores de polimorfismo de nucleótidos simples (SNP), en la plataforma del sistema Fluidigm EP1. Los SNP’s mostraron información polimórfica de 0,289 y 0,395; con  heterocigosidad observada de 0,479 y esperada de 0,378. Se obtuvieron los perfiles genéticos de las introducciones, a partir de los cuales se identificaron 16 grupos de introducciones idénticas. El análisis de probabilidad de identidad, incluyendo hermanos (PIsib), concluyó que los SNP’s fueron suficientes para diferenciar las introducciones. El promedio de heterocigosidad de las muestras fue de 0,432 siendo mayor en el grupo F (0,646) y menor en el grupo P (0,253). Los controles de genotipeo Criollo y Contamana, mostraron mayor distancia genética que los controles Trinitario, Forastero y Criollo ecuatoriano. La distancia genética máxima entre las introducciones fue de 0,167. Los resultados son consistentes con la historia del cultivo del cacao Nacional, el cual a lo largo del tiempo recibió contribuciones genéticas de otras variedades. El presente estudio constituye un avance significativo en el conocimiento de la diversidad genética del cacao Nacional de Ecuador.

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Publicado

2020-05-16

Cómo citar

Mercedes Susana, Yeny Patricia, Gerardo, José, Jaime, Nicolás, Sila, & Jaime Eduardo. (2020). Diversidad genética del cacao Nacional ecuatoriano del banco de germoplasma de Tenguel-Guayas, Ecuador, con base en SNP’S. Bioagro, 32(2), 75-86. Recuperado a partir de https://revistas.uclave.org/index.php/bioagro/article/view/2691

Número

Sección

Artículos